Учебно-методическое управление
Управление международного сотрудничества
Научно-исследовательский сектор
Патентный отдел
Отдел инновационной деятельности
Отдел программ и проектов развития
Управление по воспитательной работе
Отдел кадров
Отдел лицензирования и оценки качества образовательных программ
Управление стратегических коммуникаций
Управление правового обеспечения и документоведения
Финансово-экономическое управление
Отдел сопровождения платного обучения (ОСПО)
Центральная бухгалтерия
Сектор внутреннего контроля и аудита
Отдел закупок
Отдел организации приема и профориентации
Редакционно-издательский центр (РИЦ)
Отдел охраны труда
Региональный центр (отдел) содействия трудоустройству выпускников
Отдел управления имущественным комплексом
Эксплуатационно-технический отдел
Отдел хозяйственного обслуживания
Группа текущего ремонта
Отдел транспортного обеспечения
Штаб гражданской обороны и чрезвычайных ситуаций (ГО и ЧС)
Отдел мобилизационной подготовки
Отдел защиты государственной тайны
Управление комплексной безопасности
Координационный центр БашГУ