Проводимые на инженерном факультете научные исследования направлены на решение актуальных проблем химии, нефтехимии и нефтепереработки, в частности, разработки безотходных технологий, углубленных процессов нефтепереработки, выявления новых материалов и методов анализа, биологически активных веществ и вспомогательных материалов и т.д.

Научно-исследовательская работа ведется в тесном контакте с Институтом органической химии, Институтом нефтехимии и катализа, Институтом проблем сверхпластичности металлов Академии наук РФ, с другими научно-исследовательскими учреждениями, а также с промышленными предприятиями России.

Создание новых композиционных материалов (в том числе высокотемпературных керамических), изучение их свойств, отработка технологии изготовления изделий технического назначения являются приоритетными задачами исследований сотрудников факультета. В течение нескольких лет по этому направлению производятся работы по выполнению многомиллионных грантов предприятий с РОСНАНО.

Большое внимание уделяется исследованиям по созданию ультрадисперсных и наноматериалов, в том числе каталитических систем для нефтехимии и нефтепереработки, композиционных материалов для различных отраслей промышленности. В области создания новых каталитических систем для нефтехимии ведутся работы по выполнению грантов «Российского научного фонда» совместно с УГНТУ.

Проводится разработка новых видов оборудования, предназначенных для различных отраслей промышленности, в том числе нефтяной. В стенах инженерного факультета создаются технологическое оборудование и приборы, предназначенные для увеличения нефтеотдачи, по переработке шламов, для выполнения конкретных задач предприятий.

Развивается направление изучения растительного сырья и синтеза фармакологически активных соединений на основе экстрактивных веществ, химия пищевых и биологически активных добавок.