Кафедра востоковедения и башкирского языкознания образована 1 сентября 2017 года путем объединения двух кафедр факультета башкирской филологии и журналистики: кафедры башкирского языкознания и этнокультурного образования и кафедры востоковедения.

Как самостоятельная учебно-научная единица кафедра функционирует с 1960 года по решению Ученого совета Башкирского государственного университета на базе кафедры башкирского языка и литературы.

В целях углубленного изучения и преподавания арабского, персидского, турецкого и китайского языков при факультете башкирской филологии и журналистики для подготовки специалистов по этим языкам по специализации «Башкирский язык и литература: иностранные языки» 1 сентября 2008 года была создана кафедра востоковедения.