Штаб ГО и ЧС создан в БашГУ как постоянно действующий орган управления в объектовом звене предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций и гражданской обороны Башкирской территориальной подсистемы единой государственной системы предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций (БТП РСЧС).

Основные задачи:

• Организация выполнения положений законодательства и других нормативных правовых актов Российской Федерации и Республики Башкортостан, организационно-распорядительных документов МЧС России, Главного управления МЧС России по Республике Башкортостан, Министерства образования и науки Российской Федерации, Администрации городского округа город Уфа Республики Башкортостан, администраций Кировского, Советского и Орджоникидзевского районов городского округа город Уфа Республики Башкортостан, других вышестоящих органов, уполномоченных на решение задач в области гражданской обороны и защиты от чрезвычайных ситуаций, а также приказов и распоряжений ректора БашГУ.
• Организация планирования и реализации мероприятий по ГО и ЧС в целях обеспечения защиты обучающихся и работников, объектов БашГУ, ликвидации последствий опасностей, возникающих при ведении военных действий или вследствие этих действий, при чрезвычайных ситуациях и пожарах.
• Организация создания и поддержания в состоянии постоянной готовности к использованию технических систем управления ГО и ЧС, а также локальных систем оповещения.
• Организация работы по сбору, обработке и анализу информации о ЧС, радиационной, химической, биологической (бактериологической) обстановке, а также по подготовке предложений и соответствующей документации для комиссии по предупреждению и ликвидации чрезвычайных ситуаций и обеспечению пожарной безопасности БашГУ, эвакуационной комиссии БашГУ и комиссии по повышению функционирования объектов БашГУ по вопросам обеспечения защиты обучающихся и работников, объектов БашГУ, ликвидации последствий опасностей, возникающих при ведении военных действий или вследствие этих действий, при чрезвычайных ситуациях.
• Организация в установленном порядке подготовки работников и обучающихся БашГУ к действиям в ЧС мирного и военного времени.
• Участие в организации формирования и накопления финансовых, материально-технических и иных ресурсов, предназначенных для решения задач ГО и ЧС.
• Организация планирования и реализации мероприятий по поддержанию устойчивого функционирования объектов БашГУ при чрезвычайных ситуациях и в военное время.
• Организация создания и поддержания в состоянии постоянной готовности нештатных формирований ГО и ЧС БашГУ.